Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UHRF1Q96T88 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms