Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CCDC47Q96A33 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CCDC47Q96A33 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CCDC47Q96A33 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CCDC47Q96A33 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CCDC47Q96A33 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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