Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Q1T7F1 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Q1T7F1 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms