Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms