Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KNOP1Q1ED39 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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