Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NKPD1Q17RQ9 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms