Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HIF1AQ16665 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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