Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM25Q14258 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms