Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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