Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCINQ13939 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCINQ13939 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CCINQ13939 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CCINQ13939 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CCINQ13939 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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