Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CDH18Q13634 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CDH18Q13634 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CDH18Q13634 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CDH18Q13634 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CDH18Q13634 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CDH18Q13634 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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