Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms