Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms