Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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SGCGQ13326 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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SGCGQ13326 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SGCGQ13326 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SGCGQ13326 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SGCGQ13326 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SGCGQ13326 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SGCGQ13326 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCGQ13326 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCGQ13326 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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