Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRIM28Q13263 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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