Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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TRDNQ13061 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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TRDNQ13061 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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TRDNQ13061 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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TRDNQ13061 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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TRDNQ13061 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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TRDNQ13061 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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TRDNQ13061 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRDNQ13061 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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