Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NFIAQ12857 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms