Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VGFO15240 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VGFO15240 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VGFO15240 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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