Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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RTL8BQ17RB0 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RTL8BQ17RB0 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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