Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.18
LAMA3Q16787 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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