Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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