Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TLR1Q15399 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TLR1Q15399 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms