Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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