Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms