Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
COL4A6Q14031 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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COL4A6Q14031 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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COL4A6Q14031 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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COL4A6Q14031 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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COL4A6Q14031 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
COL4A6Q14031 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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