Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
GTF2H3Q13889 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GTF2H3Q13889 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms