Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RUNX3Q13761 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms