| RUNX3 | Q13761 | AC073968.1-201 | ENST00000618594 | 637 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FLG-AS1-207 | ENST00000628475 | 497 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098617.1-218 | ENST00000628836 | 624 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCMTD1P7-201 | ENST00000634506 | 357 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | D21S2088E-201 | ENST00000262354 | 1725 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAPPC13-208 | ENST00000505553 | 1410 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DDX43P2-201 | ENST00000604753 | 1354 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GABRG2-215 | ENST00000639213 | 9960 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-75P-201 | ENST00000347264 | 129 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-777P-201 | ENST00000364265 | 104 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA9.2-201 | ENST00000365361 | 133 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD82-201 | ENST00000365530 | 70 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU5A-2P-201 | ENST00000384337 | 116 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL31P1-201 | ENST00000398116 | 372 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC9B1P2-201 | ENST00000398120 | 1184 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121972.1-201 | ENST00000402023 | 252 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355379.1-201 | ENST00000405542 | 640 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016907.1-201 | ENST00000419483 | 435 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019178.2-201 | ENST00000423595 | 505 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087499.2-201 | ENST00000432861 | 149 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CKS1BP5-201 | ENST00000434172 | 273 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTTY20-201 | ENST00000434487 | 259 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PATE1-202 | ENST00000437148 | 457 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LARP1BP3-201 | ENST00000437229 | 869 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004485.1-201 | ENST00000439839 | 527 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KRTAP19-11P-201 | ENST00000439851 | 104 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00113-203 | ENST00000442550 | 572 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073486.1-201 | ENST00000453278 | 531 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL30P6-201 | ENST00000475925 | 342 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090453.1-201 | ENST00000495560 | 436 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5BM1P-201 | ENST00000512021 | 366 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026412.2-201 | ENST00000512270 | 1075 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092436.2-201 | ENST00000515188 | 411 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC095057.2-201 | ENST00000515422 | 553 nt | TSL 4 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-143P-201 | ENST00000516296 | 146 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024958.1-201 | ENST00000519364 | 902 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL18-204 | ENST00000528832 | 795 nt | APPRIS P3 TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP004242.1-201 | ENST00000533701 | 349 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRF1-203 | ENST00000537723 | 598 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01467-201 | ENST00000554211 | 1187 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01491-201 | ENST00000558434 | 505 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC12A1-210 | ENST00000561031 | 735 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012435.1-202 | ENST00000568772 | 240 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P6-201 | ENST00000569046 | 646 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097467.3-208 | ENST00000593486 | 670 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015871.2-201 | ENST00000603605 | 948 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP92-201 | ENST00000603609 | 255 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL596327.1-201 | ENST00000603629 | 213 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U1.23-201 | ENST00000610293 | 146 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-68P-201 | ENST00000615382 | 146 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U1.39-201 | ENST00000621562 | 146 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATXN3L-202 | ENST00000622204 | 837 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC231657.1-201 | ENST00000624313 | 397 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010976.1-210 | ENST00000630740 | 1005 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM214A-201 | ENST00000261844 | 4217 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FER-201 | ENST00000281092 | 12119 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZMYM1-201 | ENST00000359858 | 4175 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHM-205 | ENST00000615443 | 2821 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092326.2-201 | ENST00000624772 | 1561 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136360.1-201 | ENST00000503377 | 1900 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004944.1-201 | ENST00000517807 | 3059 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUP58P1-201 | ENST00000502546 | 1738 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02493-201 | ENST00000509964 | 1704 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCAT4-201 | ENST00000504263 | 2091 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DST-204 | ENST00000361203 | 22431 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P132-201 | ENST00000331267 | 462 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC062016.1-201 | ENST00000355719 | 319 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-343P-201 | ENST00000364709 | 104 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.302-201 | ENST00000364997 | 102 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-301P-201 | ENST00000384277 | 107 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-253P-201 | ENST00000384730 | 105 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR184-201 | ENST00000384962 | 84 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.29-201 | ENST00000391296 | 212 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA48.8-201 | ENST00000391324 | 134 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP56-201 | ENST00000410277 | 118 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP274-201 | ENST00000410484 | 108 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-920P-201 | ENST00000410926 | 92 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP107-201 | ENST00000411358 | 122 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPM1P11-201 | ENST00000417106 | 855 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OFD1P11Y-201 | ENST00000418213 | 1177 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P30-201 | ENST00000420888 | 709 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUP35P1-201 | ENST00000422734 | 947 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYCBP2-AS2-201 | ENST00000428716 | 428 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP74-201 | ENST00000437246 | 471 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DIAPH2-AS1-202 | ENST00000445414 | 606 nt | TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL357793.2-201 | ENST00000447056 | 850 nt | TSL 3 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL37P4-201 | ENST00000448908 | 268 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP35-201 | ENST00000451906 | 501 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009158.1-205 | ENST00000452511 | 895 nt | TSL 3 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS20P32-201 | ENST00000456044 | 356 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-136P-201 | ENST00000458819 | 69 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL30P9-201 | ENST00000465586 | 330 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL429P-201 | ENST00000479090 | 223 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL489P-201 | ENST00000486185 | 223 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL327P-201 | ENST00000488659 | 223 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SATB1-216 | ENST00000491519 | 1000 nt | TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC078817.1-201 | ENST00000492623 | 435 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084117.1-201 | ENST00000496975 | 270 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THAP6-205 | ENST00000504190 | 1004 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02229-201 | ENST00000508486 | 661 nt | TSL 3 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |