Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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