Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SEMA3FQ13275 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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