Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTGDRQ13258 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTGDRQ13258 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTGDRQ13258 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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PTGDRQ13258 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTGDRQ13258 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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