Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MKRN3Q13064 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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