Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
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