Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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USP35Q9P2H5 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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USP35Q9P2H5 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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USP35Q9P2H5 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
USP35Q9P2H5 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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