Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Q1T7F1 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
Q1T7F1 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Q1T7F1 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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