Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HIF1AQ16665 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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