Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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SPIDRQ14159 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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SPIDRQ14159 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SPIDRQ14159 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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