Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CCINQ13939 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CCINQ13939 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms