Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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TUBA3CQ13748 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TUBA3CQ13748 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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