Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MKRN4PQ13434 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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