Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTK7Q13308 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms