Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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