Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIN2AQ12879 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GRIN2AQ12879 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms