Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NFIAQ12857 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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