Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRDP23468 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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