Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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USP17L12C9JPN9 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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USP17L12C9JPN9 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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USP17L12C9JPN9 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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USP17L12C9JPN9 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP17L12C9JPN9 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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