Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
C9orf78Q9NZ63 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
C9orf78Q9NZ63 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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