Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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