Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
ZFHX3Q15911 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZFHX3Q15911 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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