Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NEDD8Q15843 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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