Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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